PDBファイルの開き方

PDBファイルタイプは主にVisual C++に割り当てられています。

PDBPDBファイル拡張子
ファイル拡張子: PDB
ファイルタイプ:  プログラム・データベース・ファイル

PDBファイルとは?

PDBファイルタイプは主にMicrosoftのVisual C++に割り当てられています。 e:PDBは、Protein Data Bankに登録されている分子の3次元構造を記述したテキストファイル形式です。タンパク質や核酸の構造について、原子座標、二次構造の割り当て、原子の連結性などの記述や注釈を提供しています。

構造。典型的なタンパク質のPDBファイルは、以下のレコードを記述した数百から数千の行で構成されています。

  • HEADER, TITLE, AUTHOR - 構造を定義した研究者の情報
  • REMARK - 自由形式の注釈で、標準化された情報にも対応できます。
  • SEQRES - ペプチド鎖の配列;
  • ATOM - タンパク質を構成する原子の座標;
  • HETATM - ヘテロ原子の座標。



関連する拡張子。PDBファイルはENTBRKとしても保存できます。レガシー: PDBは現在レガシーフォーマットとみなされており、新しいmmCIFに置き換えられています。

関連団体。e:PDBは、Microsoftのプログラム データベース ファイル - プログラムのデバッグ情報を保存するための独自のファイル形式 - を指すこともあります。

PDBファイルの開き方

PDBファイルを開くには、Visual C++などの適切なソフトウェアが必要です。 適切なソフトウェアがないと、Windowsの場合は「このファイルを開く方法を選んでください」または「Windowsはこのファイルを開けません」というメッセージ、またMac/iPhone/Androidの場合も類似の警告が表示されます。PDBファイルを正しく開けない場合、ファイルの右クリックか長押しをお試しください。その後、「プログラムから開く」をクリックしてアプリケーションを選択してください。また、PDBファイルをブラウザ:で直接表示することもできます。このブラウザのウィンドウ上にファイルをドラッグしてドロップするだけです。

オンラインPDBファイルビューアー

.pdbファイルを選択してこの画像を表示

当サイトのプライバシー保証に関しては、Filextの利用規約およびプライバシーポリシーをお読みください

私たちのサイトでの広告を許可してください

これはサーバーを稼働し続けるのに役立ちます。 次に、ファイルを再アップロードして表示します。

filext.com の広告ブロッカーを無効にする方法を確認するには、ここをクリックしてください。

PDBファイルを変換する方法 - JPG, PDF, HTML, DOC, ...

オンラインPDBファイルビューアを使って、PDBファイルを変換することができます。 (で動作しています Convert.Guru):
  1. このページの「.pdbファイルを選択してこの画像を表示」ボタンをクリックするだけでいいのです。
  2. ブラウザでファイルを開いたら、
  3. メニューから「名前を付けて保存」をクリックします。
  4. 次に、必要なファイル形式(例:PDF、JPG、DOCX、TXT、...)をクリックします。
  5. ファイルが変換され、ダウンロードされます。

PDBファイルを開いて変換できるプログラム:

  1. MicrosoftVisual C++
    メインアプリケーションに関してさらに詳しい情報は、前の段落をお読みください。 PDBファイルはしばしば、Visual C++Databaseファイルと呼ばれます。この種のファイルは主にこのソフトウェアによって作成または使用されるからです。
  2. PalmのPalm OS(Palm OSデータベースファイル)
    Palm OSは、モバイル機器向けに開発されたモバイルオペレーティングシステムでした。このOSはその後、廃止されました。p:Palm OSは、データベースを格納するコンテナとしてPDBファイルを使用していました。 このファイル・フォーマットは Database に分類されます。 関連リンク: iSilo, ウィキペディア
  3. XnSoftXnView(画像ファイル)
    p:XnViewは、XnSoftによって開発された、画像を閲覧・編集するためのフリープログラムです。このプログラムには、画像を修正するための多くの機能が含まれており、すべての主要な画像フォーマットをサポートしています。e:PDB画像ファイルはXnViewerを使って表示・編集することができます。 このファイル・フォーマットは Raster Image に分類されます。 関連リンク: ウィキペディア, ユーザーガイド
  4. Euro Sistemi SrlのPegasus Multimedia DataBase(プログラム・データベース・ファイル)
    p:Pegasus Multimedia Databaseは、Euro Sistemiによって開発された、光学アーカイブ、電子文書、マルチメディアデータを管理するためのプログラムです。このプログラムでは、これらの情報が保存されているデータベースを格納するためにPDBファイルを使用しています。 このファイル・フォーマットは Database に分類されます。
  5. SybasePowerDesigner(モデルバックアップファイル)
    p:PowerDesignerは、Sybaseが開発したプログラムで、現在はSAPが買収しています。このソフトウェアは、データアーキテクチャ、情報アーキテクチャ、エンタープライズアーキテクチャのためのデータとプロセスのモデリングに使用されます。プログラムはモデルのバックアップをPDBファイルとして保存します。 このファイル・フォーマットは Backup に分類されます。 関連リンク: Sybase Wikipedia, PowerDesigner Wikipediaのページ
  6. ETH ZürichMolMol(分子の説明ファイル)
    MolMolは、3次元分子構造を表示、分析、操作するために開発されたオープンソースのプロジェクトです。このプログラムは、PDBファイルを使って分子の説明を保存します。 このファイル・フォーマットは Simple text file に分類されます。 関連リンク: サイエンス・ダイレクトの記事, リファレンスマニュアル
  7. Avogadro
    Avogadroは、フリーでオープンソースの3D分子エディタおよびビジュアライザです。このプログラムは、タンパク質内の原子の座標を保存するために PDB ファイルを使用します。これらのファイルは、3D生物学的高分子構造データの処理と配布のための世界的なリポジトリであるProtein Data Bankでも使用されています。 このファイル・フォーマットは Data に分類されます。 関連リンク: マニュアル, ウィキペディア
  8. AdobeのPhotoDeluxe(画像ファイル)
    c:Adobe PhotoDeluxeは、2D画像を編集するためのプログラムでした。p:PhotoDeluxeは、2D画像を編集するためのプログラムでしたが、現在は廃止され、Adobeからも販売されていません。p:PhotoDeluxeはPDBファイルで保存された画像と互換性があり、プログラムで開いて編集することができました。 このファイル・フォーマットは Raster Image に分類されます。 関連リンク: ウィキペディア, アドビフォトデラックス再訪
  9. CommodoreのCommodore 64 Emulator(コモドール64エミュレータデータファイル)
    p:Commodore 64は、Commodore Internationalが開発した8ビットの家庭用コンピュータである。エミュレータは、Commodore 64のようなデバイスを最新のハードウェアでシミュレートするために使用できます。e:PDBファイルはCommodore 64のエミュレータでデータの保存に使われていましたが、現在では廃止され、どのエミュレータでも使用されていません。 このファイル・フォーマットは Data に分類されます。 関連リンク: ウィキペディア, C64 Wiki, コモドール・ウィキペディア
  10. AccelrysのInsight II
    p:Insight IIは、Accelrysが開発した分子モデリング環境で、分子動力学、ホモロジーモデリング、デノボデザイン、静電学などのアルゴリズムをグラフィカルなインターフェースで提供していました。 関連リンク: ガイド, マニュアル
  11. SybasePowerBuilder(ダイナミックリンクライブラリファイル)
    p:PowerBuilderは、もともとSybaseが開発したプログラムで、現在はSAPが所有し、Appeonが管理しています。このプログラムは、高性能なデータ駆動型のアプリケーションを作成するために使用されます。e:PDBファイルはPowerBuilderで使用されるダイナミックリンクライブラリで、ほとんどのWindowsアプリケーションのDLLファイルに似ています。 このファイル・フォーマットは System に分類されます。 関連リンク: ウィキペディア, ドキュメント
  12. Frank BergerBGBlitz(位置情報データベースファイル)
    p:BGBlitzは、Frank Bergerが開発したプロ用バックギャモンソフトウェアです。このプログラムはゲームオブジェクトの位置をPDBファイル内に保存します。 このファイル・フォーマットは Database に分類されます。 関連リンク: FAQ, インストール手順, バックギャモンのリンク
  13. PowerBASICPowerBASIC(デバッガシンボルファイル)
    p:PowerBASICは、BASICプログラミング言語のためのコンパイラのファミリーです。コンパイラは、デバッグ用のシンボルを格納するためにPDBファイルを使用します。 このファイル・フォーマットは Data に分類されます。 関連リンク: どのコンパイラを選ぶべきか?, ウィキペディア
  14. ElecosoftPowerproject Teamplan
    p:Powerprojectは、Elecosoftが販売する建設プロジェクトを管理するためのプログラムです。このプログラムはPDBファイルにデータを保存します。 このファイル・フォーマットは Data に分類されます。 関連リンク: チュートリアルビデオ, YouTubeチャンネル
  15. Mike CarsonのRibbons(タンパク質データバンクファイル)
    p:Ribbonsは、Mike Carsonによって開発された、3D分子を画像としてレンダリングするためのプログラムです。このプログラムでは、PDBという拡張子でタンパク質データバンクファイルとして保存されている座標を使って、分子モデルの画像を作成します。 このファイル・フォーマットは Data に分類されます。 関連リンク: ユーザーガイド, マニュアル
  16. TealPointTealPaint(画像ファイル)
    p:CADSTARはZukenのWindowsベースのデスクトップPCBデザインソリューションで、すぐに使用でき、レガシーデータを保存しながら現在の設計環境に簡単に統合することができます。e:PCBファイルには、物理的なボードを印刷するために使用されるレイアウトが含まれており、標準的なASCIIテキスト形式で保存されます。 このファイル・フォーマットは Raster Image に分類されます。 関連リンク: XnView, マニュアル
  17. TACT
    p:TACT(Text Analysis Computing Tools)は、文学作品のテキスト検索・分析を行う研究者向けのツールです。 関連リンク: TACTの説明, マニュアル
  18. QuickPOS

PDB フォーマットの詳細:

ファイル形式がわかっている場合は、ファイルの開き方や編集方法もわかります。 多くの場合、ファイル形式はファイル拡張子または最初のバイト (いわゆる署名) から推測できます。 ただし、異なるプログラムが同じファイル拡張子を使用している可能性があり、ファイル拡張子が正しく設定されていない可能性があります。 そのため、ファイルの詳細な分析を行って、形式と関連するプログラムを特定する必要があります。 以下に、PDB ファイルの評価を示します。

PDB は非常に一般的なファイル拡張子であり、 は、それぞれ独自のファイル形式を持つ多くのプログラムで使用されます。 ただし、次の 2 つのファイル形式が一般的です。

すべての PDB ファイルの残りの 46% は、共通の形式のないファイルです。 のようにXML, HEADER, ATOM, REMARK, ObjStore, COMPND, TITLE , CRYST. PDB ファイルをこのページにドラッグするか、上のボタン「.pdbファイルを選択してこの画像を表示」をクリックすると、ファイルのすべての詳細を取得できます。

PDBファイル拡張子に関する技術データ


以下の一覧は「Associate This!」プログラムが作成したデータベース、メインのFILExtデータベースの一部のデータ、およびユーザーから送信されたファイル拡張子情報を基に取りまとめたものです。

プログラムID: GraphicsConverterPro.pdb, ファイルタイプ: TealPaint, アプリ名: GraphicsConverter-reg
実行ファイル: GraphicsConverter.exe

プログラムID: ICPlus, アプリ名: ImageEditor Plus
実行ファイル: ICPlus.exe

プログラムID: PalmQuickInstall.PdbFile, ファイルタイプ: Palm Database File, アプリ名: Palm Quick Install Module
実行ファイル: QuickInstall.exe

プログラムID: pdbfile, ファイルタイプ: Intermediate file

プログラムID: pdbFile, ファイルタイプ: Palm Database File, アプリ名: Install Tool Application
実行ファイル: Instapp.exe

プログラムID: pdbfile, ファイルタイプ: Program Debug Database

プログラムID: PrintShop.Project, ファイルタイプ: Print Shop Project, アプリ名: Home Productivity Program

プログラムID: Demo Builder
実行ファイル: %ProgramFiles%\Demo Builder\db.exe %1

プログラムID: pdbFile
実行ファイル: %ProgramFiles%\Clie\Instapp.exe %1

プログラムID: pdbFile
実行ファイル: %ProgramFiles%\Handspring\Instapp.exe %1

プログラムID: pdbFile
実行ファイル: %ProgramFiles%\Palm\Instapp.exe %1

プログラムID: pdbFile
実行ファイル: %ProgramFiles%\Sony Handheld\Instapp.exe %1

プログラムID: pdbFile
実行ファイル: C:\Palm\Instapp.exe %1

プログラムID: pdbfile
実行ファイル: f:\utils\handspring\Instapp.exe %1

プログラムID: pdbFile
実行ファイル: C:\Palm\Instapp.exe %1

プログラムID: pdbFile
実行ファイル: %ProgramFiles%\Sony Handheld\Instapp.exe %1

プログラムID: pdbfile
実行ファイル: %ProgramFiles%\Informax\Vector NTI Suite 9\3D-Mol.exe %1

プログラムID: pdbFile
実行ファイル: %ProgramFiles%\palm\Instapp.exe %1

プログラムID: pdbFile
実行ファイル: %ProgramFiles%\Internet Explorer\Iexplore.exe %1

プログラムID: XnView.Image
実行ファイル: %ProgramFiles%\XnView\xnview.exe %1

プログラムID: PrintShopDeluxe
実行ファイル: C:\PSDWIN\psdwin.exe %1

プログラムID: PrintShop.Project
実行ファイル: C:\The Print Shop Products\The Print Shop Premier Edition 5.0\Pspe5.exe %1

プログラムID: pdbFile
実行ファイル: %ProgramFiles%\Instapp.exe %1

プログラムID: PalmQuickInstall.PdbFile
実行ファイル: %ProgramFiles%\Palm\QuickInstall.exe /FileExt

プログラムID: SDDocuments.Atomistic3dDocument.1
実行ファイル: %ProgramFiles%\Accelrys\MS Modeling 3.2\Studio\MatStudio.exe

プログラムID: PrintShop.Project
実行ファイル: %ProgramFiles%\The Print Shop Deluxe III\psdwin.exe %1

プログラムID: pdbFile
実行ファイル: %ProgramFiles%\DeLano Scientific\PyMOL\pymolwin.exe %1 %*

プログラムID: pdbFile
実行ファイル: %ProgramFiles%\Palm\Instapp.exe pdf_auto_file

プログラムID: pdbFile
実行ファイル: C:\Palm\Instapp.exe pdtfile

プログラムID: pdbfile
実行ファイル: %ProgramFiles%\Palm\Instapp.exe PDXFileType

プログラムID: pdbFile
実行ファイル: %ProgramFiles%\Sony Handheld\Instapp.exe PDFXMLDesigner.Document

プログラムID: pdbFile
実行ファイル: %ProgramFiles%\Sony Handheld\Instapp.exe pdcfile

プログラムID: pdbFile
実行ファイル: C:\Palm\Instapp.exe PerfFile

プログラムID: pdbFile
実行ファイル: %ProgramFiles%\Palm\Instapp.exe PDFXMLDesigner.Document

プログラムID: PalmQuickInstall.PdbFile
実行ファイル: %ProgramFiles%\palmOne\QuickInstall.exe /FileExt

プログラムID: pdbFile
実行ファイル: %ProgramFiles%\Handspring\Instapp.exe PerfFile

プログラムID: pdbFile
実行ファイル: %ProgramFiles%\Handspring\Instapp.exe PDXFileType

プログラムID: pdbFile
実行ファイル: %ProgramFiles%\Palm\Handspring\Instapp.exe PDVDmpgfile

プログラムID: pdbFile
実行ファイル: %ProgramFiles%\Palm\Instapp.exe PerfFile

プログラムID: pdbfile
実行ファイル: %ProgramFiles%\Invitrogen\Vector NTI Advance 10\3D-Mol.exe

プログラムID: MyViewPad.pdb
実行ファイル: %ProgramFiles%\My ViewPad\MyViewPad.exe


拡張子がpdbのプログラム・データベース・ファイルファイルはMicrosoftの特殊ファイルフォーマットで、適切なソフトウェア以外を用いて編集または保存すべきではありません。

PDBファイルの問題解決方法

  • PDBファイル拡張子を正しいアプリケーションで開くよう設定しましょう。
  • 実際にプログラム・データベース・ファイルファイルを開くソフトウェアを更新しましょう。 最新のPDBファイルフォーマットに対応しているのは最新版のみだからです。そのため、開発元のMicrosoftのウェブサイトなどでVisual C++の更新が入手できないか検索してみてください。
  • PDBファイルが破損していないか、またウイルスに感染していないかを確認するために、ファイルを再度入手してGoogleのvirustotal.comでスキャンしましょう。
  • ここをクリックして.PDBファイルをオンラインで開く - 安全、迅速、ソフトウェアのインストール不要。
こちらにドロップしてください
別のファイルを表示
PDBファイルビューアー PDBファイルの概要