Tudo sobre os Ficheiros CRAM

O tipo de ficheiro CRAM está principalmente associado a samtools.

CRAM	Extensão de ficheiro: CRAM
	Tipo de ficheiro:	formato de arquivo comprimido

O que é um ficheiro CRAM?

Os arquivos CRAM pertencem principalmente ao samtools. Arquivos CRAM vêm em duas formas principais:
Dados genômicos: Esses arquivos são arquivos BAM comprimidos que armazenam registros de alinhamento de sequências utilizando compressão baseada em referência. Eles reduzem a necessidade de armazenamento para grandes conjuntos de dados genômicos. Use ferramentas especializadas como o samtools para visualizá-los e convertê-los. Mais detalhes estão disponíveis em HTSlib.
Sistemas de arquivos ROM: Um grupo menor de arquivos CRAM são arquivos do Sistema de Arquivos ROM comprimidos usados para manter uma imagem compacta de um sistema de arquivos em dispositivos embarcados.
Detalhes principais fornecidos por FilExt.com:

Tipo de dado: Armazena dados de sequências genômicas ou imagens de sistemas de arquivos ROM.

Função: Utiliza técnicas de compressão para reduzir o tamanho do arquivo enquanto mantém a integridade dos dados.

Uso: Aplicado em bioinformática para alinhamento de sequências e em sistemas embarcados para imagens ROMFS.

Observação do FilExt.com: Esses arquivos requerem software específico para extrair e inspecionar seus conteúdos.

Como abrir um ficheiro CRAM

Precisa de um software adequado como samtools para abrir um ficheiro CRAM. Sem o software adequado, receberá uma mensagem do Windows "Como deseja abrir este ficheiro?" ou "O Windows não consegue abrir este ficheiro" ou um alerta semelhante do Mac/iPhone/Android. Se não conseguir abrir o ficheiro CRAM corretamente, tente clicar com o botão direito do rato ou manter premido o ficheiro. Em seguida, clique em "Abrir com" e escolha uma aplicação. Podes também mostrar um ficheiro CRAM directamente no browser:. Basta arrastares o ficheiro para esta janela do browser e largá-lo.

Abrir um ficheiro CRAM e visualizar os textos contidos

Escolha o seu ficheiro .cram para analisar

ou arraste e solte aqui

Pré-visualização do Ficheiro

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Programas que abrem e convertem ficheiros CRAM:

samtools
Consulte os parágrafos anteriores para saber mais sobre a aplicação principal. Os ficheiros CRAM são frequentemente chamados de ficheiros samtools Comprimido porque este tipo de ficheiro é criado ou utilizado principalmente por este software.
Sistema de ficheiros ROM comprimido
Nas variantes UNIX/Linux você utiliza o mkcramfs para criar um ficheiro .CRAM que é uma imagem comprimida de um sistema de ficheiros ROM a partir do conteúdo de um dado diretório. Os sistemas de ficheiros Cram são utilizados para as imagens INITRD da Debian.

Dados Técnicos para Extensão de Ficheiro CRAM

Classificação de ficheiros:

Comprimido

Arquivos relacionados:

bam, sam, fastq, fasta, cramfs, crai, md5, gz, loop, zip, vcs, inkml, magnet, img

Um ficheiro cram formato de arquivo comprimido é um formato de ficheiro especial e apenas deve ser editado e guardado com o software apropriado.

Como resolver problemas com ficheiros CRAM

Associe a extensão de ficheiro CRAM à aplicação correta.
Atualize o software que deve abrir os ficheiros formato de arquivo comprimido. Porque apenas a versão atual suporta o formato de ficheiro CRAM mais recente. Pesquise, por exemplo, no site do fabricante após uma atualização samtools disponível.
Para se certificar de que o seu ficheiro CRAM não está corrompido ou infetado por vírus, obtenha o ficheiro novamente e faça uma verificação com o virustotal.com do Google.
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