Tudo sobre os Ficheiros FASTA

O tipo de ficheiro FASTA está principalmente associado a DNA Baser Assembler.

FASTA	Extensão de ficheiro: FASTA
	Tipo de ficheiro:	Ficheiro de sequência de ADN e proteínas

O que é um ficheiro FASTA?

Os arquivos FASTA pertencem principalmente ao DNA Baser Assembler da Heracle BioSoft SRL. FA extensão de ficheiro é o formato de ficheiro científico padrão utilizado nos campos da bioinformática e da bioquímica. É mais popularmente conhecido como o formato de ficheiro FASTA.

• Main Use: FA formato de ficheiro foi inicialmente introduzido como parte do pacote de software FASTA e desde então tem sido aceite como a norma industrial para representar sequências de nucleótidos e proteínas. Os dados da sequência no ficheiro FA estão presentes num formato de texto simples, tornando-o facilmente compreensível também para o utilizador ler o ficheiro. A manipulação e análise da sequência FASTA pode ser feita facilmente utilizando processadores de texto padrão e linguagens de programação baseadas em scripts tais como R, Python, Perl, e Ruby. O formato de ficheiro FA é capaz de armazenar múltiplas sequências de nucleótidos/proteínas, sendo por isso também conhecido como o formato de base de dados FASTA. Os ficheiros FA podem ser analisados utilizando a maior parte do software de análise DNA do mercado.
• Features: FA ficheiros normalmente começam com uma linha de cabeçalho que inclui comentários ou outras informações descritivas relacionadas com a sequência. A primeira linha num ficheiro FA começa normalmente com um símbolo > seguido do nome da sequência. A linha seguinte contém a sequência nucleotídica ou peptídeo composta por A, T, G, e C em linha com o código IUPAC. Cada linha pode ser constituída por um máximo de 80 caracteres.

Como posso abrir um ficheiro FASTA?

Precisa de um software adequado como DNA Baser Assembler para abrir um ficheiro FASTA. Sem o software adequado, receberá uma mensagem do Windows "Como deseja abrir este ficheiro?" ou "O Windows não consegue abrir este ficheiro" ou um alerta semelhante do Mac/iPhone/Android. Se não conseguir abrir o ficheiro FASTA corretamente, tente clicar com o botão direito do rato ou manter premido o ficheiro. Em seguida, clique em "Abrir com" e escolha uma aplicação. Podes também mostrar um ficheiro FASTA directamente no browser:. Basta arrastares o ficheiro para esta janela do browser e largá-lo.

Abrir um ficheiro FASTA e visualizar os textos contidos

Escolha o seu ficheiro .fasta para visualizar

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Como extrair textos de arquivos FASTA ou tirar uma captura de tela para PDF, JPG, DOCX, TXT, ...

1. Basta clicares no botão "Escolha o seu ficheiro .fasta para visualizar" nesta página.
2. O teu ficheiro FASTA será então exibido no browser.
3. Agora clica em "Guardar como..." no topo da página.
4. Depois escolhe o formato de ficheiro (por exemplo JPG, PDF, DOCX, TXT, ...) que queres.
5. Descarrega o ficheiro convertido.

Detalhes do formato FASTA:

Se o formato do arquivo puder ser determinado, o programa associado poderá ser encontrado. Os primeiros caracteres de um arquivo são chamados de assinatura, às vezes também bytes mágicos. A assinatura pode ser usada para inferir o formato do arquivo. Freqüentemente, no entanto, uma extensão de arquivo é usada por diferentes programas para diferentes formatos de arquivo e um formato de arquivo para diferentes extensões de arquivo. Quando há um problema com um arquivo, o primeiro passo para resolvê-lo é determinar o formato do arquivo. Nossa investigação dos arquivos FASTA tem o seguinte resultado:

A extensão FASTA é muito comum e é usado por muitos programas, cada um com seu próprio formato de arquivo. Os dois formatos mais populares são os seguintes:

• 15% de todos os arquivos FASTA usam o mesmo formato de arquivo, que tem a assinatura 3E 4E. Esses arquivos contêm texto e palavras, não dados binários. A maioria desses arquivos tem tamanho de 1 KB a 5 MB. O tipo de arquivo é muito jovem. Alguns exemplos de nomes de arquivo são sequence.fasta.
• 6% de todos os arquivos FASTA começam com os bytes 3E 4D cruciais para este formato de arquivo. Esses arquivos são de texto simples, o que significa que podem ser visualizados com qualquer editor de texto como o Bloco de Notas no Windows, Nano para Linux e TextEdit para macOS. A maioria desses arquivos tem tamanho de 550 bytes a 130 KB. Exemplos de nomes de arquivos são sequence.fasta ou sample.fasta.

Os restantes 79% de todos os arquivos FASTA são arquivos diferentes com assinaturas diferentes, existem os seguintes 40 formatos: ZIP e Chain. Você pode obter todos os detalhes do seu arquivo FASTA arrastando-o para esta página ou clicando no botão "Escolha o seu ficheiro .fasta para visualizar" acima.