Eine MOL2-Datei öffnen

Der Dateityp MOL2 ist vor allem der Software SYBYL zugeordnet.

MOL2	Dateierweiterung: MOL2
	Dateityp:	MoleküLdaten-Datei

Was ist eine MOL2-Datei

MOL2 Dateien gehören meistens zu SYBYL von Certara. Tripos MOL2 ist eine ASCII-Datei im freien Format, die als portable Darstellung eines Moleküls dient, das in den Bereichen Chemieinformatik und Bioinformatik verwendet wird. Es entstand in der Expertenumgebung für molekulare Modellierung SYBYL, die von Tripos erstellt wurde. Der Inhalt dieser Dateien wird von spezialisierten Softwareumgebungen als Code interpretiert, der Informationen über Moleküle enthält.

Struktur: Die Inhaltsstruktur umfasst Kommentare und Leerzeilen sowie Abschnitte, die als „Record Type Indicators" und „Data Records" bekannt sind. Es gibt 32 verschiedene mögliche Formate eines Datensatzes, je nachdem in welchem Abschnitt der Datei der Datensatz liegt. Auf diese wird in der kostenlos erhältlichen offiziellen Dokumentation verwiesen.
Zugehörige Programme: Es gibt eine Vielzahl kostenloser Lösungen, die zum Lesen, Erstellen und Konvertieren von MOL2-Dateien verwendet werden können. Einige dieser Lösungen umfassen ICM Browser von Molsoft, Open Babel und Wolfram.

Wie öffnet man eine MOL2-Datei?

Zum Öffnen einer MOL2-Datei benötigst du eine geeignete Software wie SYBYL. Andernfalls erhältst du eine Windows-Meldung „Wie soll diese Datei geöffnet werden?“ oder „Die folgende Datei kann nicht geöffnet werden“ oder eine ähnliche Mac-, iPhone-, Android-Warnmeldung. Wenn du die MOL2-Datei nicht korrekt öffnen kannst, versuche es mit einem Rechtsklick oder durch langes Drücken auf die Datei. Klicke dann auf „Öffnen mit“ und wähle eine Anwendung aus. Du kannst eine MOL2 Datei auch direkt im Browser anzeigen:. Ziehe die Datei einfach auf dieses Browserfenster und lasse sie fallen.

MOL2 Datei öffnen und enthaltene Texte ansehen

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Wie man Texte aus MOL2 Dateien extrahiert oder ein Screenshot erstellt PDF, JPG, DOCX, TXT, ...

Wenn du Texte aus MOL2 Dateien extrahieren oder ein Screenshot erstellen möchtest, kannst du unseren kostenlosen MOL2-Datei Online Viewer verwenden:

Hierzu klicke auf dieser Seite den Button "Wähle eine .mol2-Datei zum Anzeigen".
Anschließend wird deine MOL2-Datei im Browser angezeigt.
Klicke nun oben auf der Seite auf "Speichern unter...".
Wähle dann dein bevorzugtes Dateiformat, z.B. JPG, PDF, DOCX, TXT, etc.
Downloade die umgewandelte Datei.

Programme, mit denen MOL2-Dateien geöffnet und konvertiert werden können:

SYBYL von Certara
Weitere Informationen über die Hauptanwendung findest du in den vorherigen Absätzen. MOL2-Dateien werden oft als SYBYL Simple text file-Dateien bezeichnet, da dieser Dateityp vor allem mit dieser Software erstellt bzw. darin verwendet wird.
WebLab Molecular (Viewer-Datei) von Molecular Simulations
WebLab ist eine kostenlose Software zur Darstellung von Molekülen, mit der Alpha-Helices als Zylinder dargestellt, fehlende Wasserstoffatome hinzugefügt und Reste um eine Bindung gedreht werden können. Dieses Programm ist in erster Linie für Windows und Mac OS konzipiert, kann jedoch auch unter Linux ausgeführt werden. Die Datei MOL2 enthält die Ansichtsdatei sowie die molekularen Informationen für jedes einzelne Molekül. Das Dateiformat wird klassifiziert als Data. Zugehörige Links: Kostenlose Software zur Molekularmodellierung, https://www.york.ac.uk/org/seg/salters/ChemistryArchive/download.html

Details zum MOL2-Format:

Jede Datei hat ein genau definiertes Dateiformat, d.h. eine ganz bestimmte Anordnung der Daten in dieser Datei. Ein Dateiformat wird durch die Dateierweiterung und Signatur bestimmt, JPEG-Bilder haben z.B. die Erweiterung .jpg und die ersten Bytes in der Datei sind ÿØÿ. Wenn die Dateierweiterung nicht mit dem Dateiformat übereinstimmt, führt ein Doppelklick auf diese Datei beim Öffnen zu einem Fehler. Wenn es ein Problem mit einer Datei gibt, besteht der erste Schritt zur Lösung darin, das Dateiformat zu bestimmen. Hier nun unsere Analyse von MOL2-Dateien:

MOL2 Dateien sind sehr ungewöhnlich. So eine Datei enthält verschiedene Formate für verschiedene Programme. Die zwei beliebtesten Formate sind wie folgt:

60% aller MOL2-Dateien verwenden das gleiche Dateiformat mit Signatur @<TRIPOS>MOLECULE. Diese Dateien sind Textdateien, sie enthalten also Wörter und Text. Eine typische Dateigröße ist 8 KB. Der Dateityp wurde erst in den letzten Jahren entwickelt. Folgende Schlüsselwörter sind charakteristisch: @<TRIPOS>ATOM, @<TRIPOS>MOLECULE, SMALL und USER_CHARGES.
30% aller MOL2-Dateien gehören zu Tripos Mol2. Diese Dateien enthalten Text und Wörter, keine binären Daten. MOL2-Dateien können bis zu 80 MB groß sein, haben aber oft eine Größe von etwa 2 KB - 50 KB. Folgende Schlüsselwörter sind charakteristisch: Name, @<TRIPOS>MOLECULE, SMALL, CHARGES, Created, USER, @<TRIPOS>ATOM und Creation time.

Alle anderen MOL2-Dateien (10%) haben kein einheitliches Format. Klicke einfach auf die Schaltfläche "Wähle eine .mol2-Datei zum Anzeigen" auf dieser Seite, um alle Details deiner MOL2-Datei anzuzeigen.

Technische Daten für die MOL2-Dateierweiterung

Dateiklassifizierung:

Simple text file

Ähnliche Dateien:

mol, pdb, cml, gz, zip, txt, jpg, xsr, mph

Zugehörige Links:

SYBYL herunterladen, SYBYL Wikipedia, Einführung

MIME-Typ:

chemical/x-mol2

Eine mol2 MoleküLdaten-Datei-Datei ist ein spezielles Dateiformat von Certara und sollte nur mit der entsprechenden Software bearbeitet und gespeichert werden.

Lösen von Problemen mit MOL2-Dateien

Verknüpfe die MOL2-Dateierweiterung mit der korrekten Anwendung.
Aktualisiere die Software, mit der MoleküLdaten-Datei-Dateien geöffnet werden sollen. Denn nur die aktuelle Version unterstützt das jüngste MOL2-Dateiformat. Suche daher zum Beispiel auf der Website des Herstellers Certara nach einem verfügbaren Update von SYBYL.
Um sicherzustellen, dass deine MOL2-Datei nicht beschädigt oder von einem Virus infiziert ist, hole dir die Datei erneut und scanne sie mit virustotal.com von Google.
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