Abrir um Ficheiro MOL2

O tipo de ficheiro MOL2 está principalmente associado a SYBYL.

MOL2	Extensão de ficheiro: MOL2
	Tipo de ficheiro:	ficheiro de dados da molécula

O que é um ficheiro MOL2

Os arquivos MOL2 pertencem principalmente ao SYBYL da Certara. Tripos MOL2 é um ficheiro de formato livre ASCII que actua como uma representação portátil de uma molécula utilizada nos campos da quimioterapia e da bioinformática. Teve a sua origem no experiente ambiente de modelação molecular SYBYL criado por Tripos. O conteúdo destes ficheiros é interpretado como código que contém informação sobre moléculas por ambientes de software especializado.

Estrutura: A estrutura do conteúdo inclui comentários e linhas em branco, assim como secções conhecidas como 'Indicadores de Tipo de Registo' e 'Registos de Dados'. Existem 32 formatos diferentes possíveis de um registo de dados, dependendo da secção do ficheiro em que o registo de dados reside. Todos estes são referenciados na documentação oficial disponível gratuitamente.
Programas associados: Existe uma infinidade de soluções livres que podem ser utilizadas para ler, criar e converter ficheiros MOL2. Algumas destas soluções incluem ICM Browser por Molsoft, Open Babel, e Wolfram.

Como abrir um ficheiro MOL2

Precisa de um software adequado como SYBYL para abrir um ficheiro MOL2. Sem o software adequado, receberá uma mensagem do Windows "Como deseja abrir este ficheiro?" ou "O Windows não consegue abrir este ficheiro" ou um alerta semelhante do Mac/iPhone/Android. Se não conseguir abrir o ficheiro MOL2 corretamente, tente clicar com o botão direito do rato ou manter premido o ficheiro. Em seguida, clique em "Abrir com" e escolha uma aplicação. Podes também mostrar um ficheiro MOL2 directamente no browser:. Basta arrastares o ficheiro para esta janela do browser e largá-lo.

Abrir um ficheiro MOL2 e visualizar os textos contidos

Escolha o seu ficheiro .mol2 para visualizar

ou arraste e solte aqui

Pré-visualização do Ficheiro

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Como extrair textos de arquivos MOL2 ou tirar uma captura de tela para PDF, JPG, DOCX, TXT, ...

Se você quiser extrair textos de um arquivo MOL2 ou tirar uma captura de tela, pode usar nosso Visualizador de Arquivos MOL2 Online gratuito:

Para o fazeres, clica no botão "Escolha o seu ficheiro .mol2 para visualizar" nesta página.
O teu ficheiro MOL2 será então exibido no browser.
Agora clica em "Guardar como..." no topo da página.
Depois escolhe o formato de ficheiro (por exemplo JPG, PDF, DOCX, TXT, ...) que queres.
Descarrega o ficheiro convertido.

Programas que abrem e convertem ficheiros MOL2:

SYBYL por Certara
Consulte os parágrafos anteriores para saber mais sobre a aplicação principal. Os ficheiros MOL2 são frequentemente chamados de ficheiros SYBYL Simple text file porque este tipo de ficheiro é criado ou utilizado principalmente por este software.
WebLab Molecular (ficheiro do visualizador) por Molecular Simulations
WebLab é um software gratuito de visualização molecular que pode representar hélices alfa como cilindros, adicionar átomos de hidrogénio em falta, e rodar resíduos em torno de uma ligação. Este programa foi concebido principalmente para funcionar em sistemas Windows e Mac OS, contudo, tem também as capacidades de funcionar em Linux. O ficheiro MOL2 contém o ficheiro de visualização, bem como a informação molecular para cada molécula individual. Este formato de ficheiro é classificado como Data. Hiperligações relacionadas: Software gratuito de modelação molecular, https://www.york.ac.uk/org/seg/salters/ChemistryArchive/download.html

Detalhes do formato MOL2:

Cada arquivo possui um formato de arquivo bem definido, ou seja, como os dados armazenados são dispostos no arquivo. Um formato de arquivo é determinado pela extensão e assinatura do arquivo, portanto, as imagens JPEG têm a extensão .jpg e os primeiros bytes no arquivo são ÿØÿ. Se a extensão do arquivo não corresponder ao formato do arquivo, clicar duas vezes nesse arquivo dará um erro ao abri-lo. Quando há um problema com um arquivo, o primeiro passo para resolvê-lo é determinar o formato do arquivo. Abaixo está nossa análise dos arquivos MOL2:

MOL2 raramente é usado como uma extensão de arquivo e inclui diferentes formatos para diferentes programas. Os dois formatos mais populares são os seguintes:

60% de todos os arquivos MOL2 usam o mesmo formato de arquivo, que tem a assinatura @<TRIPOS>MOLECULE. Esses arquivos são arquivos de texto, portanto, contêm palavras e texto. Um tamanho de arquivo típico é 8 KB. O tipo de arquivo foi desenvolvido apenas nos últimos anos. As seguintes palavras-chave são características: @<TRIPOS>ATOM, @<TRIPOS>MOLECULE, SMALL e USER_CHARGES.
30% de todos os arquivos MOL2 pertencem a Tripos Mol2. Esses arquivos contêm texto e palavras, não dados binários. Arquivos MOL2 podem ter tamanho de até 80 MB, mas geralmente estão em torno de 2 KB - 50 KB. As seguintes palavras-chave são características: Name, @<TRIPOS>MOLECULE, SMALL, CHARGES, Created, USER, @<TRIPOS>ATOM e Creation time.

Todos os outros arquivos MOL2 (10%) não têm formato uniforme. Basta clicar no botão "Escolha o seu ficheiro .mol2 para visualizar" nesta página para descobrir qual é o seu arquivo MOL2.

Dados Técnicos para Extensão de Ficheiro MOL2

Classificação de ficheiros:

Simple text file

Arquivos relacionados:

mol, pdb, cml, gz, zip, txt, jpg, xsr, mph

Hiperligações relacionadas:

SYBYL Descarregar, SYBYL Wikipedia, Introdução

Tipo de Mime:

chemical/x-mol2

Um ficheiro mol2 ficheiro de dados da molécula é um formato de ficheiro especial da Certara e apenas deve ser editado e guardado com o software apropriado.

Como resolver problemas com ficheiros MOL2

Associe a extensão de ficheiro MOL2 à aplicação correta.
Atualize o software que deve abrir os ficheiros ficheiro de dados da molécula. Porque apenas a versão atual suporta o formato de ficheiro MOL2 mais recente. Pesquise, por exemplo, no site do fabricante de Certara após uma atualização SYBYL disponível.
Para se certificar de que o seu ficheiro MOL2 não está corrompido ou infetado por vírus, obtenha o ficheiro novamente e faça uma verificação com o virustotal.com do Google.
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