Ouvrir un fichier MOL2

Le type de fichier MOL2 est principalement associé à SYBYL.

MOL2	Extension de fichier : MOL2
	Type de fichier :	fichier de données sur les molécules

Qu'est-ce qu'un fichier MOL2

Les fichiers MOL2 appartiennent principalement à SYBYL de Certara. Tripos MOL2 est un fichier de format libre ASCII qui sert de représentation portable d'une molécule utilisée dans les domaines de la chimio et de la bioinformatique. Il est issu de l'environnement expert de modélisation moléculaire SYBYL créé par Tripos. Le contenu de ces fichiers est interprété comme un code contenant des informations sur les molécules par des environnements logiciels spécialisés.

Structure : La structure du contenu comprend des commentaires et des lignes vides ainsi que des sections appelées "indicateurs de type d'enregistrement" et "enregistrements de données". Il existe 32 formats différents possibles d'un enregistrement de données, en fonction de la section du fichier dans laquelle l'enregistrement de données réside. Ceux-ci sont tous référencés dans la documentation officielle disponible gratuitement.
Programmes associés : Il existe une pléthore de solutions gratuites qui peuvent être utilisées pour lire, créer et convertir les fichiers MOL2. Certaines de ces solutions comprennent ICM Browser de Molsoft, Open Babel, et Wolfram.

Comment ouvrir un fichier MOL2

Vous avez besoin d'un logiciel adapté tel que SYBYL pour ouvrir un fichier MOL2. Sans logiciel adéquat, vous recevrez un message Windows « Comment souhaitez-vous ouvrir ce fichier? » ou « Windows ne peut pas ouvrir ce fichier » ou une alerte Mac / iPhone / Android similaire. Si vous ne parvenez pas à ouvrir correctement votre fichier MOL2, essayez de cliquer avec le bouton droit de la souris ou d'appuyer longuement sur le fichier. Cliquez ensuite sur « Ouvrir avec » et sélectionnez une application. Vous pouvez aussi afficher un fichier MOL2 directement dans le navigateur:. Il suffit de faire glisser le fichier sur cette fenêtre du navigateur et de le déposer.

Ouvrez un fichier MOL2 et visualisez les textes contenus

Sélectionnez le fichier .mol2 à visualiser

ou faites-le glisser et déposez-le ici

Aperçu du fichier

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Comment extraire du texte des fichiers MOL2 ou faire une capture d’écran pour PDF, JPG, DOCX, TXT, ...

Si vous voulez extraire du texte d’un fichier MOL2 ou réaliser une capture d’écran, vous pouvez utiliser notre visionneuse de fichiers MOL2 en ligne gratuite:

Pour ce faire, clique sur le bouton "Sélectionnez le fichier .mol2 à visualiser" sur cette page.
Ton fichier MOL2 s'affichera alors dans le navigateur.
Clique maintenant sur "Enregistrer sous..." en haut de la page.
Ensuite, choisis le format de fichier (par exemple JPG, PDF, DOCX, TXT, ...) que tu veux.
Télécharge le fichier converti.

Programmes qui ouvrent et convertissent les fichiers MOL2 :

SYBYL de Certara
Consultez les paragraphes précédents pour en savoir plus sur l'application principale. Les fichiers MOL2 sont souvent appelés fichiers SYBYL Simple text file car ce type de fichier est principalement créé ou utilisé par ce logiciel.
WebLab Molecular (fichier de visualisation) par Molecular Simulations
WebLab est un logiciel gratuit de visualisation moléculaire qui peut représenter des hélices alpha sous forme de cylindres, ajouter des atomes d'hydrogène manquants et faire tourner des résidus autour d'une liaison. Ce programme est principalement conçu pour fonctionner sur les systèmes Windows et Mac OS, mais il peut également fonctionner sur Linux. Le fichier MOL2 contient le fichier de visualisation ainsi que les informations moléculaires pour chaque molécule individuelle. Ce format de fichier est classé comme Data. Liens connexes : Logiciel gratuit de modélisation moléculaire, https://www.york.ac.uk/org/seg/salters/ChemistryArchive/download.html

Détails du format MOL2 :

Chaque fichier a un format de fichier bien défini, c'est-à-dire la manière dont les données stockées sont organisées dans le fichier. Un format de fichier est déterminé par l'extension et la signature du fichier, donc les images JPEG ont l'extension .jpg et les premiers octets du fichier sont ÿØÿ. Si l'extension du fichier ne correspond pas au format du fichier, un double-clic sur ce fichier générera une erreur lors de son ouverture. Lorsqu'il y a un problème avec un fichier, la première étape pour le résoudre consiste à déterminer le format du fichier. Voici notre analyse des fichiers MOL2 :

MOL2 est rarement utilisé comme extension de fichier et inclut différents formats pour les programmes applicables. Les deux formats les plus populaires sont les suivants :

60% de tous les fichiers MOL2 utilisent le même format de fichier, qui porte la signature @<TRIPOS>MOLECULE. Ces fichiers sont des fichiers texte, ils contiennent donc des mots et du texte. Une taille de fichier typique est 8 KB. Le type de fichier n'a été développé qu'au cours des dernières années. Les mots clés suivants sont caractéristiques : @<TRIPOS>ATOM, @<TRIPOS>MOLECULE, SMALL et USER_CHARGES.
30% de tous les fichiers MOL2 appartiennent à Tripos Mol2. Ces fichiers contiennent du texte et des mots, pas des données binaires. Les fichiers MOL2 peuvent avoir une taille allant jusqu'à 80 MB, mais sont souvent autour de 2 KB - 50 KB. Les mots clés suivants sont caractéristiques : Name, @<TRIPOS>MOLECULE, SMALL, CHARGES, Created, USER, @<TRIPOS>ATOM et Creation time.

Tous les autres fichiers MOL2 (10%) n'ont pas de format uniforme. Cliquez simplement sur le bouton "Sélectionnez le fichier .mol2 à visualiser" sur cette page pour savoir quel est votre fichier MOL2.

Données techniques de l'extension de fichier MOL2

Classification des fichiers :

Simple text file

Fichiers connexes :

mol, pdb, cml, gz, zip, txt, jpg, xsr, mph

Liens connexes :

SYBYL Télécharger, SYBYL Wikipedia, Introduction

Type de MIME :

chemical/x-mol2

Un fichier mol2 fichier de données sur les molécule est un format de fichier spécial de Certara et ne doit être modifié et sauvegardé qu'avec le logiciel adéquat.

Comment résoudre les problèmes liés aux fichiers MOL2

Associez l'extension de fichier MOL2 à la bonne application.
Mettez à jour votre logiciel qui doit réellement ouvrir les fichiers fichier de données sur les molécule. Parce que seule la version actuelle prend en charge le dernier format de fichier MOL2. Recherchez, par exemple, sur le site Internet du fabricant Certara si une mise à jour de SYBYL est disponible.
Pour vous assurer que votre fichier MOL2 n'est pas corrompu ou infecté par un virus, analysez-le avec virustotal.com de Google.
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