Alles über BCL-Dateien

Der Dateityp BCL ist vor allem der Software FASTQ zugeordnet.

BCL	Dateierweiterung: BCL
	Dateityp:	Basis-Rufdaten-Datei

Was ist eine BCL-Datei?

BCL Dateien gehören meistens zu FASTQ von Illumina. BCL-Dateien werden von DNA-Sequenzierungsinstrumenten, HiSeq und MiSeq erstellt und verwendet, die von Illumina entwickelt wurden.

Hauptmerkmale: Die Primäranalyse einer DNA-Probe wird mit Illumina-Sequenzierungsinstrumenten durchgeführt, um die Intensität der Kanäle bei der Kodierung verschiedener Basen zu messen und anschließend die Base (dies wird als Base-Call bezeichnet) mit der höchsten Wahrscheinlichkeit (als Q-Score bezeichnet) an einer bestimmten Position in der Probensequenz zu bestimmen. Während jedes solchen Sequenzierungszyklus erstellt die Real-Time Analysis (RTA)-Software der Illumina-Maschine eine BCL-Datei, die die Informationen dieser Basisaufrufe und die zugehörigen Qualitätswerte (Q-Scores) enthält. Die Daten in diesen BCL-Dateien werden in einem Binärformat gespeichert und repräsentieren die Rohdatenausgabe während jeder Laufsequenz. Der Prozess, der BCL-Dateien generiert, ist sehr effizient, da jeder Basisanruf separat von der Maschine aufgezeichnet wird, bevor fortgefahren wird.
Annahme: Software wie Casava, bcl2fastq, Eland und iSAAC aligner werden zur weiteren Analyse dieser rohen BCL-Dateien verwendet, indem sie in eine strukturierte Form umgewandelt und mit der Dateierweiterung FASTQ gespeichert werden. Das FASTQ-Format ist ein textbasiertes Sequenzformat, das die Rohsequenzinformationen und Qualitätsbewertungen speichert.

So öffnet man BCL Dateien

Zum Öffnen einer BCL-Datei benötigst du eine geeignete Software wie FASTQ. Andernfalls erhältst du eine Windows-Meldung „Wie soll diese Datei geöffnet werden?“ oder „Die folgende Datei kann nicht geöffnet werden“ oder eine ähnliche Mac-, iPhone-, Android-Warnmeldung. Wenn du die BCL-Datei nicht korrekt öffnen kannst, versuche es mit einem Rechtsklick oder durch langes Drücken auf die Datei. Klicke dann auf „Öffnen mit“ und wähle eine Anwendung aus. Du kannst eine BCL Datei auch direkt im Browser anzeigen:. Ziehe die Datei einfach auf dieses Browserfenster und lasse sie fallen.

BCL Datei öffnen und enthaltene Texte ansehen

Wähle eine .bcl-Datei zur Analyse

oder hier draufziehen (Drag-&-Drop)

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Programme, mit denen BCL-Dateien geöffnet und konvertiert werden können:

FASTQ von Illumina
Weitere Informationen über die Hauptanwendung findest du in den vorherigen Absätzen. BCL-Dateien werden oft als FASTQ Data-Dateien bezeichnet, da dieser Dateityp vor allem mit dieser Software erstellt bzw. darin verwendet wird.
Casava (Basis-Rufdaten-Datei) von Illumina
Die Erweiterung BCL gehört zu den Dateien, die von HiSeq und MiSeq, den DNA-Sequenzierungsgeräten von Illumina, erzeugt werden. Diese Arten von Dateien können mit CASAVA, einer von Illumina entwickelten Anwendung, gelesen und analysiert werden. Das Dateiformat wird klassifiziert als Data. Zugehörige Links: Illumina CASAVA-Dokumentation, CASAVA-Informationen
PDP-10 (Compiler-Quelldatei) von Digital Equipment Corporation
Die PDP-10 war ein Großrechner, der von Digital Equipment Corporation hergestellt wurde. Die Dateierweiterung BCL ist mit diesem Computer verbunden und speichert die Datenquellen für den Compiler. Das Dateiformat wird klassifiziert als Data. Zugehörige Links: Wikipedia PDP-10 Seite

Technische Daten für die BCL-Dateierweiterung

Dateiklassifizierung:

Data

Ähnliche Dateien:

bgzf, bc!, bclp, cbcl, dwg, exe, txt, zip, mph, ltd

Zugehörige Links:

FASTQ-Dateien Erklärung

Die folgende Liste wird aus der vom Programm „Associate This!“ erzeugten Datenbank, bestimmten Daten aus der Hauptdatenbank von FILExt und den von Benutzern übermittelten Informationen zu Dateierweiterungen zusammengestellt.

Programm-ID: BestAddress.CodeLibrary, Dateityp: BestAddress Code Library

Eine bcl Basis-Rufdaten-Datei-Datei ist ein spezielles Dateiformat von Illumina und sollte nur mit der entsprechenden Software bearbeitet und gespeichert werden.

Lösen von Problemen mit BCL-Dateien

Verknüpfe die BCL-Dateierweiterung mit der korrekten Anwendung.
Aktualisiere die Software, mit der Basis-Rufdaten-Datei-Dateien geöffnet werden sollen. Denn nur die aktuelle Version unterstützt das jüngste BCL-Dateiformat. Suche daher zum Beispiel auf der Website des Herstellers Illumina nach einem verfügbaren Update von FASTQ.
Um sicherzustellen, dass deine BCL-Datei nicht beschädigt oder von einem Virus infiziert ist, hole dir die Datei erneut und scanne sie mit virustotal.com von Google.
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