Wszystko o plikach BCL
Typ pliku BCL jest głównie powiązany z FASTQ.
Co to jest plik BCL?
- Główne cechy: Analiza pierwotna próbki DNA jest przeprowadzana przy użyciu Illumina przyrządy do sekwencjonowania do pomiaru intensywności kanałów w kodowaniu różnych zasad, a następnie ustalenia zasady (nazywa się to wywołaniem zasady) o najwyższym prawdopodobieństwie (nazywanym wynikiem Q) w określonej pozycji w sekwencji próbki. Podczas każdego takiego cyklu sekwencjonowania oprogramowanie Real-Time Analysis (RTA) z maszyny Illumina tworzy BCL plik zawierający informacje o tych wywołaniach podstawowych i związanych z nimi wartościach jakościowych (wyniki Q). Dane w tych BCL plikach są przechowywane w formacie binarnym i reprezentują surowe dane wyjściowe podczas każdej sekwencji uruchamiania. Proces, który generuje BCL plików jest bardzo wydajny, ponieważ każde wywołanie bazy jest oddzielnie rejestrowane przez maszynę przed kontynuowaniem.
- Zastosowanie: oprogramowanie, takie jak Casava,bcl2fastq, Eland i iSAAC aligner są używane do dalszej analizy tych nieprzetworzonych plików BCL poprzez konwersję ich na ustrukturyzowany formularz i zapisany z rozszerzeniem pliku FASTQ. Format FASTQ to tekstowy format sekwencji, w którym zapisywane są informacje o nieprzetworzonej sekwencji i wyniki jakości.
Jak otwierać pliki BCL?
Aby otworzyć plik BCL, potrzebujesz odpowiedniego oprogramowania, takiego jak FASTQ. Bez zainstalowanego odpowiedniego oprogramowania zobaczysz komunikat systemu Windows: „Jak chcesz otworzyć ten plik?” lub „System Windows nie może otworzyć tego pliku” lub podobny wiadomość Mac/iPhone/Android. Jeśli nie możesz otworzyć pliku BCL, spróbuj kliknąć go prawym przyciskiem myszy lub przytrzymać go. Następnie kliknij „Otwórz za pomocą” i wybierz żądany program. Możesz też wyświetlić plik BCL bezpośrednio w przeglądarce:. Po prostu przeciągnij i upuść plik w oknie przeglądarki.
Przeglądanie online zawartości pliku BCL
Przeczytaj o gwarancji prywatności w zasadach FILExt.com i Prywatność Polityka
Zezwól na reklamy w naszej witrynie
Pomaga nam to w utrzymaniu działania naszych serwerów. Następnie prześlij ponownie swój plik, aby go wyświetlić.Kliknij tutaj, aby zobaczyć, jak wyłączyć blokowanie reklam dla filext.com
Programy do otwierania i konwertowania BCL plików:
- FASTQ от Illumina
Przeczytaj poprzednie akapity, aby dowiedzieć się więcej o głównej aplikacji. Pliki BCL są często powiązane z plikami FASTQ_ Data, ponieważ ten typ pliku został pierwotnie utworzony lub używany przez ten program.
- Casava (bazowy plik danych połączeń) od IlluminaRozszerzenie BCL należy do plików generowanych przez HiSeq i MiSeq, DNA instrumenty do sekwencjonowania Illumina. Tego rodzaju pliki można odczytywać i analizować za pomocą CASAVA, aplikacji opracowanej przez Illumina. Ten format pliku jest sklasyfikowany jako Data. Powiązane linki: Dokumentacja Illumina CASAVA, Informacje o CASAVA
- PDP-10 (plik źródłowy kompilatora) od Digital Equipment CorporationPDP-10 był komputerem typu mainframe produkowanym przez Digital Equipment Corporation. Rozszerzenie pliku BCL jest powiązane z tym komputerem i przechowuje źródła danych dla kompilatora. Ten format pliku jest sklasyfikowany jako Data. Powiązane linki: Strona Wikipedii poświęcona PDP-10
Dane techniczne dla rozszerzenia pliku BCL
Poniższa lista została skompilowana przy użyciu bazy danych „Associate This!”, wybranych danych z bazy danych FILExt.com oraz informacji o rozszerzeniu pliku wysłanych w użytkowników.
bcl bazowy plik danych połączeń to specjalny format pliku z Illumina, który można edytować i zapisywać tylko za pomocą odpowiedniego oprogramowania.
Jak rozwiązywać problemy z plikami BCL
- Powiąż rozszerzenie pliku BCL z odpowiednią aplikacją.
- Zaktualizuj oprogramowanie, aby otwierać pliki, takie jak bazowy plik danych połączeń. Ponieważ tylko aktualna wersja obsługuje aktualny format pliku BCL. Dlatego poszukaj na przykład najnowszej aktualizacji programu FASTQ w witrynie programisty Illumina.
- Aby upewnić się, że plik BCL nie jest uszkodzony ani zainfekowany wirusem, zeskanuj go za pomocą witryny virustotal.com firmy Google.
- Kliknij tutaj, aby otworzyć swój plik .BCL online - bezpiecznie, szybko i bez konieczności instalacji oprogramowania.