Tutto sui file BCL

Il tipo di file BCL è principalmente associato a FASTQ.

BCL	Estensione file: BCL
	Tipo di file:	file di dati delle chiamate di base

Cos'è un file BCL?

I file BCL appartengono principalmente a FASTQ di Illumina. I file BCL sono creati e utilizzati dagli strumenti di sequenziamento DNA, HiSeq e MiSeq che sono sviluppati da Illumina.

• Caratteristiche principali: L'analisi primaria di un campione di DNA viene eseguita utilizzando gli strumenti di sequenziamento Illumina per misurare l'intensità dei canali nella codifica di varie basi e successivamente stabilire la base (chiamata chiamata chiamata base call) con la maggiore probabilità (chiamata punteggio Q) in una particolare posizione nella sequenza del campione. Durante ogni ciclo di sequenziamento, il software Real-Time Analysis (RTA) della macchina Illumina crea un file BCL contenente le informazioni di queste chiamate di basi e i valori di qualità associati (punteggi Q). I dati in questi file BCL sono memorizzati in un formato binario e sono rappresentativi dei dati grezzi prodotti durante ogni sequenza di esecuzione. Il processo che genera i file BCL è molto efficiente poiché ogni chiamata di base viene registrata separatamente dalla macchina prima di procedere oltre.
• Adattamento: Software come Casava,bcl2fastq, Eland e iSAAC aligner sono utilizzati per un'ulteriore analisi di questi file grezzi BCL convertendoli in una forma strutturata e salvati con estensione di file FASTQ. Il formato FASTQ è un formato di sequenza basato sul testo che salva le informazioni sulla sequenza grezza e i punteggi di qualità.

Come aprire i file BCL

Per aprire un file BCL, è necessario un software appropriato come, ad esempio, FASTQ. Senza un software appropriato, visualizzerai il messaggio di Windows "Come vuoi aprire questo file?" o "Impossibile aprire il file" o un avviso simile di Mac/iPhone/Android. Se non riesci ad aprire correttamente il file BCL, prova a fare clic con il pulsante destro del mouse o a premere a lungo il dito sul file. Quindi, fai clic su "Apri con" e scegli un'applicazione. Puoi anche visualizzare un file BCL direttamente nel browser:. Basta trascinare il file su questa finestra del browser e rilasciarlo.

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BCL formato file:

Il formato del file, che è la disposizione e il tipo di dati in un file, determina quale programma può aprire il file. Spesso il formato del file può essere dedotto dall'estensione del file o dai primi byte (la cosiddetta firma). Spesso, tuttavia, un'estensione di file viene utilizzata da programmi diversi per formati di file diversi e un formato di file per estensioni di file diverse. Quindi è necessaria un'analisi dettagliata di un file per scoprire il formato e il programma associato. La nostra valutazione dei file BCL si presenta così:

L'estensione del file BCL non viene utilizzata così spesso e include vari formati per vari programmi. I formati di file che si trovano più comunemente nei file BCL sono:

• 35% di tutti i file BCL memorizza i dati nel formato file UTF-8. UTF-8 è la codifica dei caratteri più comune del World Wide Web per Unicode. I file UTF-8 possono essere visualizzati con qualsiasi editor di testo. Questi file iniziano con i 3 byte  (hex: EF BB BF), il cosiddetto byte order mark (BOM). Questi file sono file di testo, quindi contengono parole e testo. La dimensione media dei file è 78 bytes con la maggior parte dei file di dimensioni comprese tra 52 bytes e 180 bytes. Il tipo di file non è molto vecchio. I file contengono le seguenti parole: Users e Desktop. Un nome di file comune è ConversionList1.bcl.
• 5% di tutti i file BCL utilizza il popolare formato di file config. Un file di configurazione viene utilizzato dal software del computer per memorizzare le impostazioni. Consiste in un contenuto basato su testo con una struttura e una sintassi comprendenti coppie chiaveâ per le proprietà e sezioni che organizzano le proprietà. Questi file sono file di testo e possono quindi essere letti con un editor di testo. I file hanno spesso dimensioni comprese tra 420 bytes e 500 bytes. Alcune parole si trovano quasi sempre nei file come [Log], hash e imei.

Il rimanente 60% di tutti i file BCL sono file diversi con firme diverse, come GZIP, XML, laD e Sub. Puoi ottenere tutti i dettagli del tuo file BCL trascinandolo in questa pagina o facendo clic sul pulsante "Scegli il file .bcl da analizzare" sopra.