dal 2000
Tutto sui file BCL
Il tipo di file BCL è principalmente associato a FASTQ.
Cos'è un file BCL?
I file BCL appartengono principalmente a FASTQ di Illumina. I file BCL sono creati e utilizzati dagli strumenti di sequenziamento DNA, HiSeq e MiSeq che sono sviluppati da Illumina.
- Caratteristiche principali: L'analisi primaria di un campione di DNA viene eseguita utilizzando gli strumenti di sequenziamento Illumina per misurare l'intensità dei canali nella codifica di varie basi e successivamente stabilire la base (chiamata chiamata chiamata base call) con la maggiore probabilità (chiamata punteggio Q) in una particolare posizione nella sequenza del campione. Durante ogni ciclo di sequenziamento, il software Real-Time Analysis (RTA) della macchina Illumina crea un file BCL contenente le informazioni di queste chiamate di basi e i valori di qualità associati (punteggi Q). I dati in questi file BCL sono memorizzati in un formato binario e sono rappresentativi dei dati grezzi prodotti durante ogni sequenza di esecuzione. Il processo che genera i file BCL è molto efficiente poiché ogni chiamata di base viene registrata separatamente dalla macchina prima di procedere oltre.
- Adattamento: Software come Casava,bcl2fastq, Eland e iSAAC aligner sono utilizzati per un'ulteriore analisi di questi file grezzi BCL convertendoli in una forma strutturata e salvati con estensione di file FASTQ. Il formato FASTQ è un formato di sequenza basato sul testo che salva le informazioni sulla sequenza grezza e i punteggi di qualità.
Come aprire i file BCL
Per aprire un file BCL, è necessario un software appropriato come, ad esempio, FASTQ. Senza un software appropriato, visualizzerai il messaggio di Windows "Come vuoi aprire questo file?" o "Impossibile aprire il file" o un avviso simile di Mac/iPhone/Android. Se non riesci ad aprire correttamente il file BCL, prova a fare clic con il pulsante destro del mouse o a premere a lungo il dito sul file. Quindi, fai clic su "Apri con" e scegli un'applicazione. Puoi anche visualizzare un file BCL direttamente nel browser:. Basta trascinare il file su questa finestra del browser e rilasciarlo.
Aprire un file BCL e visualizzare i testi contenuti
oppure trascinalo qui
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Programmi con cui è possibile aprire e convertire i file BCL:
- FASTQ di Illumina
Per maggiori informazioni sull'applicazione principale, consulta i paragrafi precedenti. I file BCL sono spesso indicati come file di FASTQ Data perché questo tipo di file viene principalmente creato o utilizzato da tale software.
- Casava (file di dati delle chiamate di base) di IlluminaL'estensione BCL appartiene ai file generati da HiSeq e MiSeq, gli strumenti di sequenziamento DNA di Illumina. Questi tipi di file possono essere letti e analizzati usando CASAVA, un'applicazione sviluppata da Illumina. Questo formato di file è classificato come Data. Collegamenti correlati: Documentazione Illumina CASAVA, Informazioni su CASAVA
- PDP-10 (file sorgente del compilatore) di Digital Equipment CorporationIl PDP-10 era un computer mainframe prodotto dalla Digital Equipment Corporation. L'estensione del file BCL è associata a questo computer e memorizza le fonti di dati per il compilatore. Questo formato di file è classificato come Data. Collegamenti correlati: Pagina PDP-10 su Wikipedia
Dati tecnici riguardanti l'estensione file BCL
Classificazione dei file:
Data
Collegamenti correlati:
Il seguente elenco è compilato dal database prodotto dal programma "Associate This!", dai dati selezionati dal database principale di FILExt e dalle informazioni sull'estensione file inviate dagli utenti.
ProgramID: BestAddress.CodeLibrary, FileType: BestAddress Code Library
Un file file di dati delle chiamate di base bcl è un formato file speciale di Illumina e deve essere modificato e salvato solo con il software appropriato.
Come risolvere i problemi relativi ai file BCL
- Associa l'estensione file BCL all'applicazione giusta.
- Aggiorna il software che dovrebbe effettivamente aprire i file file di dati delle chiamate di base. Tieni presente che solo la versione corrente supporta l'ultimo formato file BCL. Pertanto, cerca, ad esempio, sul sito web del produttore Illumina, un aggiornamento disponibile di FASTQ.
- Per assicurarti che il file BCL non sia danneggiato o che non contenga virus, recupera il file e scansionalo con virustotal.com di Google.
- Clicca qui per aprire il tuo file .BCL online - sicuro, veloce e senza bisogno di installare software.