Todo sobre los archivos BCL

El tipo de archivo BCL está asociado principalmente con FASTQ.

BCL	Extensión de archivo: BCL
	Tipo de archivo:	archivo de datos de la llamada base

¿Qué es un archivo BCL?

Los archivos BCL pertenecen principalmente a FASTQ de Illumina. Los archivos BCL son creados y utilizados por los instrumentos de secuenciación de ADN, HiSeq y MiSeq desarrollados por Illumina.

• Características principales: El análisis primario de una muestra de ADN se realiza con los instrumentos de secuenciación de Illumina para medir la intensidad de los canales en la codificación de varias bases y, posteriormente, establecer la base (lo que se denomina llamada de base) con mayor probabilidad (llamada puntuación Q) en una posición concreta de la secuencia de la muestra. Durante cada uno de estos ciclos de secuenciación, el Análisis en tiempo real (RTA) de la máquina Illumina crea un archivo BCL que contiene la información de estas llamadas de base y los valores de calidad asociados (puntuaciones Q). Los datos de estos archivos BCL se almacenan en formato binario y son representativos de la salida de datos en bruto durante cada secuencia de ejecución. El proceso que genera los archivos BCL es muy eficiente, ya que cada llamada de base es registrada por separado por la máquina antes de seguir adelante.
• Adopción: Programas informáticos como Casava,bcl2fastq, Eland y iSAAC aligner se utilizan para el análisis posterior de estos archivos BCL en bruto, convirtiéndolos en una forma estructurada y guardándolos con la extensión de archivo FASTQ. El formato FASTQ es un formato de secuencia basado en texto que guarda la información de la secuencia en bruto y las puntuaciones de calidad.

Cómo abrir los archivos BCL

Necesitas un software adecuado como FASTQ para abrir un archivo BCL. Sin un software adecuado, recibirás un mensaje de Windows diciendo: "¿Cómo quieres abrir este archivo?" o "Windows no puede abrir este archivo" o una alerta similar de Mac/iPhone/Android. Si no puedes abrir el archivo BCL correctamente, intenta hacer clic derecho o mantener presionado el archivo. Después, haz clic en "Abrir con" y elige una aplicación. También puedes mostrar un archivo BCL directamente en el navegador:. Sólo tienes que arrastrar el archivo a esta ventana del navegador y soltarlo.

Abrir un archivo BCL y ver los textos que contiene

Elige el archivo .bcl para analizar

o arrástralo y suéltalo aquí

Vista previa de archivo

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Formato de archivo BCL:

El formato de archivo, que es la disposición y el tipo de datos en un archivo, determina qué programa puede abrir el archivo. A menudo, el formato del archivo se puede deducir de la extensión del archivo o de los primeros bytes (la llamada firma). A menudo, sin embargo, diferentes programas utilizan una extensión de archivo para diferentes formatos de archivo y un formato de archivo para diferentes extensiones de archivo. Por lo tanto, necesita un análisis detallado de un archivo para averiguar el formato y el programa asociado. Nuestra evaluación de los archivos BCL se ve así:

La extensión de archivo BCL no se usa tan a menudo y incluye varios formatos para varios programas. Los formatos de archivo que se encuentran más comúnmente en los archivos BCL son:

• 35% de todos los archivos BCL almacenan los datos en el formato de archivo UTF-8. UTF-8 es la codificación de caracteres más común de la World Wide Web para Unicode. Los archivos UTF-8 se pueden ver con cualquier editor de texto. Estos archivos comienzan con los 3 bytes  (hex: EF BB BF), la llamada marca de orden de bytes (BOM). Estos archivos son archivos de texto, por lo que contienen palabras y texto. El tamaño de archivo promedio es 78 bytes y la mayoría de los archivos tienen un tamaño entre 52 bytes y 180 bytes. El tipo de archivo no es muy antiguo. Los archivos contienen las siguientes palabras: Users y Desktop. Un nombre de archivo común es ConversionList1.bcl.
• 5% de todos los archivos BCL utilizan el popular formato de archivo config. El software de la computadora utiliza un archivo de configuración para almacenar configuraciones. Consiste en un contenido basado en texto con una estructura y sintaxis que comprende pares clave-valor para propiedades y secciones que organizan las propiedades. Estos archivos son archivos de texto y, por lo tanto, se pueden leer con un editor de texto. Los archivos suelen tener un tamaño de entre 420 bytes y 500 bytes. Casi siempre se encuentran algunas palabras en los archivos, como [Log], hash y imei.

El 60% restante de todos los archivos BCL son archivos diferentes con firmas diferentes, como GZIP, XML, laD y Sub. Puedes obtener todos los detalles de tu archivo BCL arrastrándolo a esta página o haciendo clic en el botón "Elige el archivo .bcl para analizar" arriba.