Tudo sobre os Ficheiros BCL

O tipo de ficheiro BCL está principalmente associado a FASTQ.

BCL	Extensão de ficheiro: BCL
	Tipo de ficheiro:	ficheiro de dados da chamada de base

O que é um ficheiro BCL?

Os arquivos BCL pertencem principalmente ao FASTQ da Illumina. Os ficheiros BCL são criados e utilizados por DNA instrumentos de sequenciação, HiSeq e MiSeq que são desenvolvidos por Illumina.

Principais Características: Análise primária de uma amostra DNA é realizada usando Illumina instrumentos de sequenciação para medir a intensidade dos canais na codificação de várias bases e subsequentemente estabelecer a base (a isto chama-se uma chamada de base) com a maior probabilidade (chamada pontuação Q) numa posição particular na sequência da amostra. Durante cada um destes ciclos de sequenciação, o Real-Time Analysis (RTA) software da máquina Illumina cria um ficheiro BCL contendo a informação destas chamadas de base e os valores de qualidade associados (Q scores). Os dados nestes ficheiros BCL são armazenados num formato binário e são representativos da saída de dados em bruto durante cada sequência de execução. O processo que gera ficheiros BCL é muito eficiente, uma vez que cada chamada de base é registada separadamente pela máquina antes de se prosseguir.
Adoção: Software como Casava,bcl2fastq, Eland e iSAAC aligner são utilizados para análise posterior destes ficheiros em bruto BCL, convertendo-os num formulário estruturado e guardados com extensão de ficheiro FASTQ. O formato FASTQ é um formato sequencial baseado em texto que guarda a informação em bruto da sequência e pontuações de qualidade.

Como abrir ficheiros BCL

Precisa de um software adequado como FASTQ para abrir um ficheiro BCL. Sem o software adequado, receberá uma mensagem do Windows "Como deseja abrir este ficheiro?" ou "O Windows não consegue abrir este ficheiro" ou um alerta semelhante do Mac/iPhone/Android. Se não conseguir abrir o ficheiro BCL corretamente, tente clicar com o botão direito do rato ou manter premido o ficheiro. Em seguida, clique em "Abrir com" e escolha uma aplicação. Podes também mostrar um ficheiro BCL directamente no browser:. Basta arrastares o ficheiro para esta janela do browser e largá-lo.

Abrir um ficheiro BCL e visualizar os textos contidos

Escolha o seu ficheiro .bcl para analisar

ou arraste e solte aqui

Pré-visualização do Ficheiro

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Programas que abrem e convertem ficheiros BCL:

FASTQ por Illumina
Consulte os parágrafos anteriores para saber mais sobre a aplicação principal. Os ficheiros BCL são frequentemente chamados de ficheiros FASTQ Data porque este tipo de ficheiro é criado ou utilizado principalmente por este software.
Casava (ficheiro de dados da chamada de base) por Illumina
A extensão BCL pertence aos ficheiros gerados por HiSeq e MiSeq, os instrumentos de sequenciamento DNA de Illumina. Estes tipos de ficheiros podem ser lidos e analisados utilizando CASAVA, uma aplicação desenvolvida por Illumina. Este formato de ficheiro é classificado como Data. Hiperligações relacionadas: Documentação do Illumina CASAVA, Informações sobre CASAVA
PDP-10 (ficheiro fonte do compilador) por Digital Equipment Corporation
O PDP-10 era um computador mainframe fabricado pela Digital Equipment Corporation. A extensão de ficheiro BCL está associada a este computador e armazena as fontes de dados para o compilador. Este formato de ficheiro é classificado como Data. Hiperligações relacionadas: Página da Wikipedia sobre o PDP-10

Dados Técnicos para Extensão de Ficheiro BCL

Classificação de ficheiros:

Data

Arquivos relacionados:

bgzf, bc!, bclp, cbcl, dwg, exe, txt, zip, mph, ltd

Hiperligações relacionadas:

Explicação dos ficheiros FASTQ

A seguinte listagem é compilada a partir da base de dados produzida pelo programa "Associate This!", dados selecionados da base de dados FILExt principal e informações da extensão de ficheiro enviadas pelos utilizadores.

ID do Programa: BestAddress.CodeLibrary, Tipo de Ficheiro: BestAddress Code Library

Um ficheiro bcl ficheiro de dados da chamada de base é um formato de ficheiro especial da Illumina e apenas deve ser editado e guardado com o software apropriado.

Como resolver problemas com ficheiros BCL

Associe a extensão de ficheiro BCL à aplicação correta.
Atualize o software que deve abrir os ficheiros ficheiro de dados da chamada de base. Porque apenas a versão atual suporta o formato de ficheiro BCL mais recente. Pesquise, por exemplo, no site do fabricante de Illumina após uma atualização FASTQ disponível.
Para se certificar de que o seu ficheiro BCL não está corrompido ou infetado por vírus, obtenha o ficheiro novamente e faça uma verificação com o virustotal.com do Google.
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