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BEDファイルの開き方
BEDファイルタイプは主にIntegrated Genome Browserに割り当てられています。
BEDファイルとは？
BEDファイルタイプは主にThe University of North Carolina at CharlotteのIntegrated Genome Browserに割り当てられています。
- Features: BEDファイルは、Browser Extensible Dataの頭文字をとったもので、バイオインフォマティクスの研究で使用され、UCSC Genome Browserで処理することができます。ゲノムデータとリンクされたアノテーションをテキスト形式で保存するために使用されます。e:BEDファイルは、タブ区切りのファイルで、ゲノム領域ごとに間隔を空けて割り当てられた1行を持っています。各行のフィールド数は、アノテーショントラックの各データセットで統一されている必要があります。各行には、ゲノム領域を記述するための3つの必須フィールドに加え、タブを区切りとして最大9つのフィールドを追加することができます。これらのオプションフィールドには、ゲノム領域、スコア、鎖の向き（+/-）などの情報を追加できますが、数字の大きいフィールドに移る前に、必ず数字の小さいフィールドに入力する必要があります。3つの必須フィールドBEDのうち、最初のフィールドは、染色体を指定するために使用されます。
- Adoption: BEDファイルは、UNIX、LINUX、Apple OS X環境で動作するコマンドラインベースのアプリケーションであるbedtoolsを使用して読み込んだり修正したりすることができます。IGV (Integrative Genomics Viewer)(Integrative Genomics Viewer)はJAVAベースのアプリケーションで、BEDファイルを扱うことができます。UCSC Genome Browser BEDファイルのデータを読み込むことができるWebベースのブラウザです。
BEDファイルの開き方
BEDファイルを開くには、Integrated Genome Browserなどの適切なソフトウェアが必要です。 適切なソフトウェアがないと、Windowsの場合は「このファイルを開く方法を選んでください」または「Windowsはこのファイルを開けません」というメッセージ、またMac/iPhone/Androidの場合も類似の警告が表示されます。BEDファイルを正しく開けない場合、ファイルの右クリックか長押しをお試しください。その後、「プログラムから開く」をクリックしてアプリケーションを選択してください。また、BEDファイルをブラウザ:で直接表示することもできます。このブラウザのウィンドウ上にファイルをドラッグしてドロップするだけです。
オンラインBEDテキストビューアー
こちらにドラッグ&ドロップしてください
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BEDファイルを開いて変換できるプログラム：
- The University of North Carolina at CharlotteのIntegrated Genome Browser
メインアプリケーションに関してさらに詳しい情報は、前の段落をお読みください。 BEDファイルはしばしば、Integrated Genome BrowserDataファイルと呼ばれます。この種のファイルは主にこのソフトウェアによって作成または使用されるからです。
- Blue ElephantのInfoSnorkel（インターネットデータファイル）e:BEDは、ユーザーがニュースページをカスタマイズできるアプリケーションであるInfoSnorkelに関連するファイル拡張子です。このファイルには、おそらくWebページから抽出されたデータが含まれています。 このファイル・フォーマットは Web (source) に分類されます。
- Genomatix Software GmbHのRegionMiner（ゲノム領域ファイル）拡張子BEDはRegionMinerに関連付けられており、プログラムが解析したゲノムデータに関連するデータで、各ゲノム領域に1行ずつで構成されています。 このファイル・フォーマットは Data に分類されます。 関連リンク： BEDファイルフォーマット
BED ファイル形式:
ファイル形式は、ファイル内でのデータの配置方法を定義します。 ファイルの最初の文字は署名と呼ばれ、マジック バイトと呼ばれることもあります。署名を使用して、ファイル形式を推測できます。 ただし、異なるプログラムが同じファイル拡張子を使用できます。さらに、ファイル拡張子の名前が誤って変更される可能性があり、それをダブルクリックすると、ファイルを開くときにエラーが表示されます。 知識は力です。これは、不明なファイルや欠陥のあるファイルを扱う場合にも当てはまります。 BED ファイルの評価は次のようになります。
BED ファイルの末尾は非常に一般的で、 さまざまなプログラムのさまざまな形式が含まれています。 ただし、次の 2 つのファイル形式が一般的です。
- すべての BED ファイルの 55% は、このファイル形式にとって重要なバイト chr で始まります。 これらのファイルの内容は、テキスト エディタで簡単に読み取ることができます。 BED ファイルのサイズは 23 bytes から 770 KB の間です。 ファイルの種類はそれほど古いものではありません。
- すべての BED ファイルの 10% は、このファイル形式にとって重要なバイト 6C 1B 01 で始まります。 これらのファイルには、テキストも単語も含まれておらず、データのみが含まれています。 平均ファイル サイズは 59 MB で、ほとんどのファイルのサイズは 160 KB から 580 MB の間です。
他のすべての BED ファイル (35%) には、統一されたフォーマットがありません。 UCSC BED Annotation Track, DOC, track, GFS, Chr, Loop , Scaffold など。 ドラッグ＆ドロップここにファイルをドロップして、ファイル形式と BED ファイルのプレビューを確認してください。
BEDファイル拡張子に関する技術データ
ファイルの分類：
Data
関連ファイル：
関連リンク：
MINEタイプ：
以下の一覧は「Associate This!」プログラムが作成したデータベース、メインのFILExtデータベースの一部のデータ、およびユーザーから送信されたファイル拡張子情報を基に取りまとめたものです。
プログラムID： BmcBed.Edit
実行ファイル： %ProgramFiles%\Lover's Eye\bin\BolyEdit.exe
実行ファイル： %ProgramFiles%\Lover's Eye\bin\BolyEdit.exe
拡張子がbedのゲノムデータファイルファイルはThe University of North Carolina at Charlotteの特殊ファイルフォーマットで、適切なソフトウェア以外を用いて編集または保存すべきではありません。
BEDファイルの問題解決方法
- BEDファイル拡張子を正しいアプリケーションで開くよう設定しましょう。
- 実際にゲノムデータファイルファイルを開くソフトウェアを更新しましょう。 最新のBEDファイルフォーマットに対応しているのは最新版のみだからです。そのため、開発元のThe University of North Carolina at CharlotteのウェブサイトなどでIntegrated Genome Browserの更新が入手できないか検索してみてください。
- BEDファイルが破損していないか、またウイルスに感染していないかを確認するために、ファイルを再度入手してGoogleのvirustotal.comでスキャンしましょう。
- ここをクリックして.BEDファイルをオンラインで開く - 安全、迅速、ソフトウェアのインストール不要。