Bir BED Dosyasını Açma

BED dosya türü öncelikle Integrated Genome Browser ile ilişkilendirilir.

BEDDosya Uzantısı BED
Dosya uzantısı: BED
Dosya tipi:  genomik veri dosyası

BED dosyası nedir?

BED dosyaları çoğunlukla The University of North Carolina at Charlotte tarafından üretilen Integrated Genome Browser'e aittir. BED dosyaları biyoinformatik araştırmalarında kullanılır ve UCSC Genome Browser tarafından işlenebilir.

  • Özellikler:BED Tarayıcı Genişletilebilir Verilerinin kısaltmasıdır. Genomik verileri ve bağlantılı ek açıklamaları bir metin biçiminde kaydetmek için kullanılır. BED dosyaları sekmeyle ayrılmış dosyalardır ve her genomik bölge için ayrılmış bir satır aralığına sahiptir. Her satırdaki alan sayısının, bir açıklama izindeki her bir veri kümesinde tek tip olması gerekir. Bu satırların her biri, sınırlayıcı olarak sekmeleri kullanarak dokuz adede kadar ek alan ekleme seçeneğiyle bir genomik bölgeyi tanımlamak için üç zorunlu alan içerir. Bu isteğe bağlı alanlar, genomik bölge, skor ve iplik oryantasyonu (+/-) gibi bilgileri eklemek için kullanılabilir, ancak daha yüksek numaralı alanlara geçmeden önce her zaman düşük numaralı alanları doldurmak gerekir. Üç zorunlu BED alanından ilki, kromozomu belirtmek için kullanılır. İkinci ve üçüncü zorunlu alanlar, genomik bölgenin başlangıç ​​ve bitiş konumlarını belirtmek için kullanılır.
  • Benimseme:BED dosyaları komut satırı tabanlı bir uygulama olan bedtools kullanılarak okunabilir ve değiştirilebilir UNIX, LINUX ve Apple OS X ortamlarında çalışabilir. IGV (Integrative Genomics Viewer), BED dosyalarını işlemek için kullanılabilen JAVA tabanlı bir uygulamadır. UCSC Genome BrowserBED dosyalarından verilerin yüklenebileceği web tabanlı bir tarayıcı.

BED dosyası nasıl açılır

Bir BED dosyasını açmak için Integrated Genome Browser gibi uygun bir yazılıma ihtiyacınız var. Uygun yazılım olmadan, "Bu dosyayı nasıl açmak istiyorsunuz?" veya "Windows bu dosyayı açamıyor" veya benzer bir Mac/iPhone/Android Windows mesajı alacaksınız. Alarm. BED dosyanızı doğru açamıyorsanız, dosyaya sağ tıklamayı veya uzun basmayı deneyin. Ardından "Birlikte aç"ı tıklayın ve bir uygulama seçin. Bir BED dosyasını doğrudan tarayıcıda da görüntüleyebilirsiniz:. Dosyayı bu tarayıcı penceresine sürükleyin ve bırakın.

Çevrimiçi BED Metin Görüntüleyici

Analiz etmek için .bed dosyanızı seçin

Filex'in şartlarında ve gizlilik politikasında gizlilik garantimizi okuyun

Lütfen sitemizde reklamlara izin verin

Bu, sunucularımızı çalışır durumda tutmamıza yardımcı olur. Daha sonra görüntülemek için dosyanızı yeniden yükleyin.

Filext.com için reklam engelleyicinin nasıl devre dışı bırakılacağını görmek için burayı tıklayın

BED dosyalarını açan ve dönüştüren programlar:

  1. The University of North Carolina at Charlotte tarafından Integrated Genome Browser
    Ana uygulama hakkında daha fazla bilgi edinmek için önceki paragraflara bakın. BED dosyalarına genellikle Integrated Genome Browser Data dosyaları denir çünkü bu tür dosyalar öncelikle bu yazılım tarafından oluşturulur veya kullanılır.
  2. InfoSnorkel (internet veri dosyası) ile Blue Elephant
    BED, kullanıcıların haber sayfalarını özelleştirmesini mümkün kılan bir uygulama olan InfoSnorkel ile ilişkili dosya uzantısıdır. Dosya, büyük olasılıkla bir web sayfasından alınan verileri içerir. Bu dosya biçimi Web (source) olarak sınıflandırılmıştır.
  3. RegionMiner (genomik bölgeler dosyası) ile Genomatix Software GmbH
    RegionMiner, Genomatix Software tarafından üretilen daha eski bir genom analiz yazılımıdır. BED uzantısı, RegionMiner ile ilişkilendirilir ve her genomik bölge için bir satır olacak şekilde program tarafından analiz edilen genom verilerine ait verilerden oluşur. Bu dosya biçimi Data olarak sınıflandırılmıştır. İlgili Bağlantılar: BED Dosya Formatı

BED Dosya Uzantısı için Teknik Veriler

Dosya sınıflandırması:
Data
İlişkili dosyalar:
bedgraph, gz, bigbed, fam, bedpe, bim, zip, txt, refgene, bb, wig, list, tsv, xlsx, gff3, pdf, bad, ped, bam, gff
Mim tipi:

Aşağıdaki liste, 'Associate This!' tarafından üretilen veri tabanından derlenmiştir. programı, ana FILExt veritabanından seçilen veriler ve kullanıcılar tarafından gönderilen dosya uzantısı bilgileri.

Program Kimliği: BmcBed.Edit
EXE Dosyası: %ProgramFiles%\Lover's Eye\bin\BolyEdit.exe


bed genomik veri dosyası dosyası, The University of North Carolina at Charlotte tarafından özel bir dosya biçimidir ve yalnızca uygun yazılımla düzenlenmeli ve kaydedilmelidir.

BED dosyaları ile ilgili sorunlar nasıl çözülür?

  • BED dosya uzantısını doğru uygulama ile ilişkilendirin.
  • genomik veri dosyası dosyalarını gerçekten açması gereken yazılımınızı güncelleyin. Çünkü yalnızca mevcut sürüm en son BED dosya biçimini destekler. Bu nedenle, örneğin mevcut bir Integrated Genome Browser güncellemesinden sonra The University of North Carolina at Charlotte üretici web sitesinde arama yapın.
  • BED dosyanızın bozuk veya virüslü olmadığından emin olmak için dosyayı tekrar alın ve Google tarafından virustotal.com ile tarayın.
  • .BED dosyanızı çevrimiçi açmak için buraya tıklayın - güvenli, hızlı ve yazılım kurulumu gerekmez.
Buraya bırak
Başka bir dosyayı görüntüle
BED dosya görüntüleyici BED dosya açıklaması