自 2000 年
打开 BED 文件
BED 文件类型主要与 Integrated Genome Browser 相关联。
什么是 BED 文件?
BED 文件大多属于 The University of North Carolina at Charlotte 的 Integrated Genome Browser。 BED 文件用于生物信息学研究,可以被 UCSC Genome Browser 处理。
- 特性:BED 是浏览器可扩展数据的首字母缩写。它用于以文本格式保存基因组数据和链接注释。 BED 文件是制表符分隔的文件,并为每个基因组区域分配一行。每行中的字段数需要在注释轨道中的每个单个数据集中保持一致。这些行中的每一行都包含三个用于描述基因组区域的必填字段,可以选择使用制表符作为分隔符添加最多九个附加字段。这些可选字段可用于添加基因组区域、分数和链方向 (+/-) 等信息,但始终需要在移动到编号较高的字段之前填充较低编号的字段。三个必需的 BED 字段中的第一个用于指定染色体。第二和第三个必填字段用于表示基因组区域的开始和结束位置。
- 采用:BED 可以使用基于命令行的应用程序 bedtools 读取和修改文件可以在 UNIX、LINUX 和 Apple OS X 环境中运行。 IGV (Integrative Genomics Viewer) 是一个基于 JAVA 的应用程序,可用于处理 BED 文件。 UCSC Genome Browser 一个基于 Web 的浏览器,可以将 BED 文件中的数据加载到该浏览器上。
如何打开 BED 文件
您需要像 Integrated Genome Browser 这样的合适软件来打开 BED 文件。 如果没有适当的软件,您将收到一条 Windows 消息“您想如何打开此文件?”或“Windows 无法打开此文件”或类似的 Mac/iPhone/Android警报。 如果您无法正确打开您的 BED 文件,请尝试右键单击或长按该文件。 然后单击“打开方式”并选择一个应用程序。 您也可以直接在浏览器中显示BED文件:。 只需将文件拖放到此浏览器窗口中即可。
在线BED文本查看器
或将其拖放到此处
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打开和转换BED文件的程序:
- Integrated Genome Browser by The University of North Carolina at Charlotte
请参阅前面的段落以了解有关主应用程序的更多信息。 BED 文件通常被称为 Integrated Genome Browser Data 文件,因为这种类型的文件主要由该软件创建或使用。
- InfoSnorkel (互联网数据文件) 由 Blue ElephantBED 是与 InfoSnorkel 关联的文件扩展名,该应用程序使用户可以自定义新闻页面。该文件包含最有可能从网页中提取的数据。 此文件格式归类为 Web (source)。
- RegionMiner (基因组区域文件) 由 Genomatix Software GmbHRegionMiner 是 Genomatix Software 开发的较老的基因组分析软件。扩展名 BED 是与 RegionMiner 相关联,由与程序分析的基因组数据有关的数据组成,每个基因组区域有一行。 此文件格式归类为 Data。 相关链接: BED 文件格式
BED 文件扩展名的技术数据
文件分类:
Data
相关文件:
相关链接:
哑剧类型:
以下列表是从“Associate This!”生成的数据库中编译的。 程序,从主 FILExt 数据库中选择的数据和文件扩展名信息用户提交。
程序 ID: BmcBed.Edit
EXE 文件: %ProgramFiles%\Lover's Eye\bin\BolyEdit.exe
EXE 文件: %ProgramFiles%\Lover's Eye\bin\BolyEdit.exe
bed 基因组数据文件 文件是 The University of North Carolina at Charlotte 的一种特殊文件格式,只能使用适当的软件进行编辑和保存。
如何解决 BED 文件的问题
- 将 BED 文件扩展名与正确的应用程序相关联。
- 更新应该实际打开 基因组数据文件 文件的软件。 因为只有当前版本支持最新的BED文件格式。 因此,在可用的 Integrated Genome Browser 更新后,例如在 The University of North Carolina at Charlotte 制造商网站上进行搜索。
- 为确保您的 BED 文件未损坏或未感染病毒,请再次获取该文件并使用 Google 的 virustotal.com 对其进行扫描。
- 点击这里在线打开您的.BED文件 - 安全、快速,无需安装软件。