Abrir un archivo BED

El tipo de archivo BED está asociado principalmente con Integrated Genome Browser.

BED	Extensión de archivo: BED
	Tipo de archivo:	archivo de datos genómicos

¿Qué es un archivo BED?

Los archivos BED pertenecen principalmente a Integrated Genome Browser de The University of North Carolina at Charlotte. Los archivos BED se utilizan en la investigación bioinformática y pueden ser procesados por UCSC Genome Browser.

Características: BED es un acrónimo de Browser Extensible Data. Se utiliza para guardar datos genómicos y anotaciones vinculadas en un formato de texto. Los archivos BED son archivos delimitados por tabulaciones y poseen una línea de espacio asignado para cada región genómica. El número de campos de cada línea debe ser uniforme en cada conjunto de datos de una pista de anotación. Cada una de estas líneas contiene tres campos obligatorios para describir una región genómica, con la opción de añadir hasta nueve campos adicionales utilizando tabulaciones como delimitadores. Estos campos opcionales pueden utilizarse para añadir información como la región genómica, la puntuación y la orientación de la hebra (+/-), pero siempre es necesario rellenar los campos de numeración inferior antes de pasar a los de numeración superior. El primero de los tres campos obligatorios BED se utiliza para designar el cromosoma. El segundo y el tercer campo obligatorios se utilizan para designar las posiciones inicial y final de la región genómica.
Adopción: Los archivos BED pueden leerse y modificarse mediante bedtools, una aplicación basada en la línea de comandos que puede ejecutarse en entornos UNIX, LINUX y Apple OS X. IGV (Integrative Genomics Viewer) es una aplicación basada en JAVA que puede utilizarse para manejar archivos BED. UCSC Genome Browser es un navegador basado en la web en el que se pueden cargar los datos de los archivos BED.

Cómo abrir un archivo BED

Necesitas un software adecuado como Integrated Genome Browser para abrir un archivo BED. Sin un software adecuado, recibirás un mensaje de Windows diciendo: "¿Cómo quieres abrir este archivo?" o "Windows no puede abrir este archivo" o una alerta similar de Mac/iPhone/Android. Si no puedes abrir el archivo BED correctamente, intenta hacer clic derecho o mantener presionado el archivo. Después, haz clic en "Abrir con" y elige una aplicación. También puedes mostrar un archivo BED directamente en el navegador:. Sólo tienes que arrastrar el archivo a esta ventana del navegador y soltarlo.

Abrir un archivo BED y ver los textos que contiene

Elige el archivo .bed para analizar

o arrástralo y suéltalo aquí

Vista previa de archivo

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Programas que abren y convierten archivos BED:

Integrated Genome Browser de The University of North Carolina at Charlotte
Consulta los párrafos anteriores para obtener más información sobre la aplicación principal. Los archivos BED se suelen denominar archivos Integrated Genome Browser Data porque este tipo de archivo se crea o utiliza principalmente por este software.
InfoSnorkel (archivo de datos de internet) de Blue Elephant
BED es la extensión de archivo asociada a InfoSnorkel, una aplicación que permite a los usuarios personalizar las páginas de noticias. El archivo contiene datos probablemente extraídos de una página web. Este formato de archivo está clasificado como Web (source).
RegionMiner (archivo de regiones genómicas) de Genomatix Software GmbH
La extensión BED está asociada a RegionMiner y consiste en datos pertenecientes a los datos del genoma analizados por el programa con una línea para cada región genómica. Este formato de archivo está clasificado como Data. Enlaces relacionados: Formato de archivo BED

Formato de archivo BED:

Un formato de archivo define cómo se organizan los datos en el archivo. Los primeros caracteres de un archivo se denominan firma, a veces también bytes mágicos. La firma se puede utilizar para inferir el formato del archivo. Sin embargo, diferentes programas pueden usar la misma extensión de archivo. Además, la extensión de un archivo se puede renombrar incorrectamente, y al hacer doble clic en él, se muestra un error al abrirlo. El conocimiento es poder: esto también se aplica cuando se trata de archivos desconocidos o defectuosos. Nuestra evaluación de los archivos BED se ve así:

La terminación del archivo BED es muy común y incluye diferentes formatos para diferentes programas. Pero los siguientes dos formatos de archivo son comunes:

55% de todos los archivos BED comienzan con los bytes chr, que son cruciales para este formato de archivo. El contenido de estos archivos se puede leer fácilmente con un editor de texto. Los archivos BED tienen un tamaño de entre 23 bytes y 770 KB. El tipo de archivo no es muy antiguo.
10% de todos los archivos BED comienzan con los bytes 6C 1B 01 cruciales para este formato de archivo. Estos archivos no contienen ni textos ni palabras, solo datos. El tamaño de archivo promedio es 59 MB y la mayoría de los archivos tienen un tamaño entre 160 KB y 580 MB.

Todos los demás archivos BED (35%) no tienen un formato uniforme, como UCSC BED Annotation Track, DOC, track, GFS, Chr, Loop y Scaffold. Arrastra y amperio; suelta tu archivo aquí para ver el formato de archivo y una vista previa de tu archivo BED.

Datos técnicos de la extensión de archivo BED

Clasificación de archivos:

Data

Archivos relacionados:

bedgraph, gz, bigbed, fam, bedpe, bim, zip, txt, refgene, bb, wig, list, tsv, xlsx, gff3, pdf, bad, ped, bam, gff

Enlaces relacionados:

Página de Wikipedia del Navegador del Genoma Integrado

Tipo de medio:

text/plain

La siguiente lista está compilada a partir de la base de datos producida por el programa "Associate This!", datos seleccionados de la base de datos principal de FILExt e información de extensiones de archivos enviada por los usuarios.

Identificación del programa: BmcBed.Edit
Archivo EXE: %ProgramFiles%\Lover's Eye\bin\BolyEdit.exe

Un archivo bed archivo de datos genómico es un formato de archivo especial de The University of North Carolina at Charlotte y solo debe editarse y guardarse con el software apropiado.

Cómo resolver problemas con los archivos BED

Asocia la extensión de archivo BED con la aplicación correcta.
Actualiza el software que debe abrir los archivos archivo de datos genómico. El motivo es que solo la versión actual es compatible con el último formato de archivo BED. Por lo tanto, busca, por ejemplo, en la página web del fabricante The University of North Carolina at Charlotte una actualización disponible de Integrated Genome Browser.
Para asegurarte de que el archivo BED no esté dañado o infectado por virus, obtén el archivo nuevamente y escanéalo con virustotal.com de Google.
Haz clic aquí para abrir tu archivo .BED en línea - seguro, rápido y sin necesidad de instalar software.